Fakultas Teknik Universitas Yapis Papua mendorong dosen dan mahasiswa untuk aktif dalam kegiatan penelitian yang relevan dengan kebutuhan pembangunan daerah dan perkembangan ilmu pengetahuan. Berbagai penelitian yang dihasilkan diarahkan untuk memberikan solusi atas permasalahan teknis, lingkungan, dan sosial di Papua.

Hasil penelitian dipublikasikan melalui jurnal ilmiah, seminar nasional dan internasional, serta media akademik lainnya, sebagai bentuk kontribusi nyata dalam pengembangan ilmu dan inovasi teknologi. Berikut ini adalah daftar penelitian yang telah dilakukan: